Moet hebben Bioinformatica Voor Linux
ProteinShop is een interactief hulpmiddel voor het manipuleren van eiwitstructuren. Het werd ontworpen om een reeks van eiwitten configuraties met behulp van de menselijke kennis en intuïtie snel te creëren. Deze configuraties kunnen worden onderworpen...
pyNetConv is een Python bibliotheek gecreëerd om de omzetting van een aantal netwerk bestandsformaten helpen.Sinds versie 0.6, pyNetConv is in staat om te lezen / schrijven (en omzetten van / naar) de volgende...
Pysam is een Python module voor het lezen en bewerken van Samfiles & nbsp;. Het is een lichtgewicht wrapper van de samtools C-API.De snelstartgids is hier. Meer gedetailleerde documentatie is hier beschikbaar.Vragen en opmerkingen zijn zeer welkom en...
PySCeS is een project ontwikkeld door de Triple-J Group for Molecular Cell Physiology & nbsp;. Om model te proberen en begrijpen van de complexe processen en systemen die deel uitmaken van de levende cel Kenmerken . Een tekst gebaseerde model...
reciprocal_smallest_distance is een paarsgewijze orthologie algoritme dat de wereldwijde sequentiealignering en maximum likelihood evolutionaire afstand tussen sequenties om nauwkeurig orthologa tussen genoom detecteert gebruikt. Het installeren van een...
RFLP planner is een instrument dat helpt om een RFLP experiment plannen: Het vindt restrictie enzymen die een set van homoloog DNA-sequenties op verschillende manieren knippen en resulterende beeld van de gel- elektroforese simuleert. Het programma...
Seal is een Python module die sequentiealignering biedt op Hadoop.Seal is een van MapReduce applicatie voor biologische sequence alignment. Het draait op Hadoop (http://hadoop.apache.org) via Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), een Python MapReduce en...
seriesoftubes is een uitgebreide pijpleiding Solexa ChIP-seq data.Pakket Documentatie
Eisen
...
bouwsystemen als make worden vaak gebruikt om ingewikkelde werkstromen, bijv creëren in de bioinformatica & nbsp;. snakemake gericht op de complexiteit van het creëren van workflows te verminderen door middel van een schone en moderne domeinspecifieke...
SSuMMo is een bibliotheek van functies ontworpen rond iteratief gebruik HMMER om sequenties toewijzen aan taxa & nbsp;. De resultaten zijn zeer geannoteerde bomen met species / genus distributie binnen die gemeenschap.Programma's die bij de broncode...
