Moet hebben Bioinformatica Voor Linux

grondel is een Python API voor het lezen van binaire data bestanden die zijn gemaakt met behulp van de grondel next-gen data management framework.Normaal gesproken, deze map wordt geleverd als onderdeel van de volledige Goby pakket, verkrijgbaar bij:&...

. HTSeq is een Python kader te verwerken en gegevens van high-throughput sequencing (HTS) assays analyseren Eisen < li>...

Jmol is een open source, platformonafhankelijke en gratis grafische software die oorspronkelijk is ontworpen om te fungeren als moleculaire kijker voor 3D-chemische structuren. Het werkt in vier zelfstandige modi, zoals een HTML5-webapp, een...

LSim superposes macromoleculaire elektron dichtheden en berekent een structurele gelijkenis score. De berekeningen schalen lineair met de grootte van de moleculen die worden vergeleken.De LSim uitlijningen zijn conceptueel los van biochemische en...

MacMolPlt is een modern grafisch programma voor het plotten van 3-D moleculaire structuren en normale modi (trillingen). Moderne...

MACS2 is een model gebaseerde analyse tool voor ChIP-Seq gegevens.Met de verbetering van sequencing technieken, chromatine immunoprecipitatie gevolgd door high throughput sequencing (ChIP-Seq) wordt steeds populairder om genoom-brede eiwit-DNA interacties...

massXpert mass spectrometry pakket is een massaspectrometrie omgeving voor lineaire (bio-) polymeren. Het erft alle innovaties van GNU polyxmass, want het is een haven van dat project tot een cross-platform ontwikkelomgeving Wat is nieuw in deze...

MetagenomeDB is een Python library ontworpen om gemakkelijk op te slaan, op te halen en te annoteren metagenomic sequenties & nbsp;. MetagenomeDB fungeren als een abstractielaag bovenop een MongoDB database. Het biedt een API om twee soorten objecten,...

MISO (mengsel van isovormen) is een probabilistisch raamwerk geschreven in Python dat het expressieniveau & nbsp kwantificeert; van alternatief gesplitste genen van RNA-Seq data, en identificeert differentieel gereguleerde isovormen of exons tegenover...

mpiBLAST is een MPI gebaseerd parallelle uitvoering van NCBI BLAST. Het project bestaat uit een paar programma's die formatdb vervangen en blastall met versies die BLAST banen te voeren in parallel op een cluster van computers met MPI geïnstalleerd....