LSim superposes macromoleculaire elektron dichtheden en berekent een structurele gelijkenis score. De berekeningen schalen lineair met de grootte van de moleculen die worden vergeleken.
De LSim uitlijningen zijn conceptueel los van biochemische en structurele elementen zijn dus onpartijdige en slechts geschikt voor structuur eiwit gelijkenis studies.
Installatie:
Pak de distributie file:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Verplaatsen naar bestand directory:
cd lsim.1.0.0
Kopiëren, verplaatsen of koppelen het uitvoerbare bestand lsim naar een geschikte locatie -en zorg ervoor lsim is toegankelijk via de PATH-omgeving met variabele, bijvoorbeeld:
lsim cp / usr / local / bin
Stel variabele LSIMDIR om te wijzen op de gekozen LSim directory, bijvoorbeeld:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0
Reacties niet gevonden