Best Bioinformatica Voor Linux
MetagenomeDB is een Python library ontworpen om gemakkelijk op te slaan, op te halen en te annoteren metagenomic sequenties & nbsp;. MetagenomeDB fungeren als een abstractielaag bovenop een MongoDB database. Het biedt een API om twee soorten objecten,...
SSuMMo is een bibliotheek van functies ontworpen rond iteratief gebruik HMMER om sequenties toewijzen aan taxa & nbsp;. De resultaten zijn zeer geannoteerde bomen met species / genus distributie binnen die gemeenschap.Programma's die bij de broncode...
tigreBrowser is een genexpressie model browser voor de resultaten van tigre R pakket (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installatie: tigreBrowser vereist Python versie> = 2.5. tigreBrowser kan geïnstalleerd worden met het...
MACS2 is een model gebaseerde analyse tool voor ChIP-Seq gegevens.Met de verbetering van sequencing technieken, chromatine immunoprecipitatie gevolgd door high throughput sequencing (ChIP-Seq) wordt steeds populairder om genoom-brede eiwit-DNA interacties...
edittag is een toepassing voor het ontwerpen van de collectie sets bewerken metrische sequence tags, het controleren van sequence tags voor bevestiging aan het bewerken metrische, en het integreren van sequence tags naar platform-specifieke sequencing...
MacMolPlt is een modern grafisch programma voor het plotten van 3-D moleculaire structuren en normale modi (trillingen). Moderne...
picme is een Python-pakket bevat programma's in te schatten en plot fylogenetische informativiteit voor grote datasets. installatie Voor het moment, de makkelijkste manier om het programma te installeren is:git clone git:...
SyntenyMiner is een toepassing om te visualiseren en te ondervragen vergelijkingen tussen meerdere volledige genoom sequenties. De interface biedt een bevaarbare overzicht van wedstrijden met een referentie genoomsequentie. Sequence wedstrijden tussen...
ProteinShop is een interactief hulpmiddel voor het manipuleren van eiwitstructuren. Het werd ontworpen om een reeks van eiwitten configuraties met behulp van de menselijke kennis en intuïtie snel te creëren. Deze configuraties kunnen worden onderworpen...
PySCeS is een project ontwikkeld door de Triple-J Group for Molecular Cell Physiology & nbsp;. Om model te proberen en begrijpen van de complexe processen en systemen die deel uitmaken van de levende cel Kenmerken . Een tekst gebaseerde model...
