Nieuw Bioinformatica Voor Linux
STEPS is een pakket voor de exacte stochastische simulatie van de reactie-diffusie systemen in willekeurige complexe 3D geometrieën. De kern simulatie-algoritme is een implementatie van Gillespie SSA uitgebreid te behandelen diffusie van moleculen over de...
NEO (Neurale Ensemble Objects) en is een project om een gemeenschappelijke set van base classes die moet worden ingezet in neurale data-analyse, met als doel het krijgen OpenElectrophy, NeuroTools en misschien andere projecten met dezelfde doelen meer...
OpenElectrophy is een raamwerk voor manipulatie, opslag en analyse van elektrofysiologische gegevens te vergemakkelijken. Het kan gegevens uit vele verschillende bestandsformaten importeren en bewaar ze in een enkel SQL-database type.Analyse-instrumenten...
PEAT is een suite van programma's voor het vastleggen, het voorspellen en analyseren van biofysische eigenschappen van eiwitten.Zie http://enzyme.ucd.ie/PEAT voor documentatie, instructies, screenshots etc Eisen . ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) is een efficiënt programma dat relatief korte nucleotidesequenties tegen een lange referentiesequentie uitgelijnd zoals het menselijk genoom.De software implementeert twee algoritmen, BWA-kort en BWA-SW. De vroegere werken...
SSuMMo is een bibliotheek van functies ontworpen rond iteratief gebruik HMMER om sequenties toewijzen aan taxa & nbsp;. De resultaten zijn zeer geannoteerde bomen met species / genus distributie binnen die gemeenschap.Programma's die bij de broncode...
grondel is een Python API voor het lezen van binaire data bestanden die zijn gemaakt met behulp van de grondel next-gen data management framework.Normaal gesproken, deze map wordt geleverd als onderdeel van de volledige Goby pakket, verkrijgbaar bij:&...
PySCeS is een project ontwikkeld door de Triple-J Group for Molecular Cell Physiology & nbsp;. Om model te proberen en begrijpen van de complexe processen en systemen die deel uitmaken van de levende cel Kenmerken . Een tekst gebaseerde model...
Pysam is een Python module voor het lezen en bewerken van Samfiles & nbsp;. Het is een lichtgewicht wrapper van de samtools C-API.De snelstartgids is hier. Meer gedetailleerde documentatie is hier beschikbaar.Vragen en opmerkingen zijn zeer welkom en...
TRMiner is een Python-programma dat gericht is op wetenschappelijke gegevens curatoren & nbsp;. Het maakt het mogelijk om snel te snoeien grote collecties van wetenschappelijke publicaties tot zinnen die relevant zijn voor een bepaalde mijnbouw doel.Dit...
