Bio-Linux

Bio-Linux is een open source besturingssysteem gebaseerd op de wereld & rsquo; s meest populaire gratis distributie van Linux, Ubuntu, gebouwd rond de moderne Unity desktop-omgeving, en ontworpen vanaf de grond opgebouwd door bioinformaticians.Distributed om te worden gebruikt als een single, dual-arch Levende DVDThe distro kan worden gedownload van Softoware als een enkele, dual-arch live DVD ISO images van ongeveer 3 GB in grootte, de ondersteuning van zowel 64-bit (x86_64) en 32-bits (i386) instructieset architecturen. Het moet worden ingezet om een ​​USB flash drive of dvd-schijf om het te starten vanaf de BIOS van een computer.Boot optionsBeing gebaseerd op Ubuntu, het beschikt over een identieke bootloader, ontworpen om u om het besturingssysteem te proberen zonder iets te installeren , direct beginnen met de installateur, test het RAM geheugen op fouten, opstarten vanaf de eerste schijf, evenals de integriteit van de bootable medium te controleren (alleen bij gebruik van een DVD-media) .Modern en productieve desktopomgeving aangedreven door UnityAs genoemd, de distributie & rsquo ; s standaard en enige desktop omgeving is Eenheid, waarin een panel / dock layout gebruikt. Terwijl het paneel, die is gelegen op het bovenste gedeelte van het scherm, is perfect voor interactie met actieve programma's, zal het dok u helpen om snel te starten van uw favoriete applications.Some van de beste open source bioinformatica appsSome van de beste open source bioinformaticatoepassingen zijn opgenomen in deze Ubuntu-gebaseerde besturingssysteem, waaronder wij noemen Act, Arb, Cn3D, Cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, clustalx, Dendroscope, DDV Sequence Alignment Viewer, Entrez, eQTL, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, GGobi, ISACreator, koning, LRmapqtl, mesquite en Jemboss.Bottom lineSumming up, Bio-Linux is een echt snel en productief besturingssysteem op basis van de laatste upstream Ubuntu-versie en het gebruik van de GNOME Classic desktop-omgeving, evenals enkele van de beste open source bioinformaticatoepassingen

Wat is nieuw in deze release:.

• Adressen een recente uitgave met de desktop niet aan beginnen op VirtualBox wegens incompatibele stuurprogramma's.
• Updates verschillende pakketten, met name QIIME en Bowtie-Bio gereedschappen.
• Voegt de pandaseq gepaarde einde assembler.
• Het voegt de update beginners Zelfstudie specifiek voor Bio-Linux-8.

Wat is nieuw in versie 8.0.2:

• Nieuwe Ubuntu 14.04 basissysteem ondersteunt de nieuwste hardware en biedt up-to-date office software, multimedia, etc.
• bijgewerkte versies van de belangrijkste bio-informatica toepassingen zoals QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-Bio gereedschappen en nog veel meer (gebruikers die niet upgraden zal niet meer updates te krijgen).
• Up-to-date versies van veel R-pakketten, waaronder ggplot2, DESeq en Edger plus bijgewerkt Bioconductor en duizenden meer pakketten beschikbaar voor directe installatie via C2D4U.
• Het verstrekken van pre-en-klare templates voor gebruik op VMWare / VirtualBox.
• Vervanging van NX met x2go, een meer flexibele versie van de snelle en veilige remote-desktop systeem.
• Het opnemen van de MATE desktop als een lichtgewicht alternatief voor de Eenheid.
• Een meer robuuste verpakking van de Melkweg, met ondersteuning voor het laden van hulpmiddel-schuur gereedschappen, Apache proxy, geautomatiseerde PostgreSQL set-up, authenticatie om lokale accounts en SFTP-bestand upload.
• Een gratis kitten met elke download!
• ... ok, ik kan hebben gelogen over het kitten, maar we hebben wel een aantal prachtige nieuwe wallpapers door de gebruikersgemeenschap ingediend - zie hieronder
.

Wat is nieuw in versie 7.0.3:

• Bio-Linux-7 is een volledig functionele, krachtige , configureerbaar en gemakkelijk te bioinformatica werkstation te behouden. Bio-Linux biedt meer dan 500 bioinformatica-programma's op een Ubuntu Linux 12.04 LTS basis. Er is een grafisch menu voor bio-informatica-programma's, evenals gemakkelijke toegang tot de Bio-Linux documentatie bio-informatica-systeem en sample gegevens die nuttig zijn voor het testen van programma's.
• Bio-Linux 7 voegt vele verbeteringen ten opzichte van de vorige versies, waaronder de Galaxy analyse-omgeving. Er zijn ook diverse arrangementen aan nieuwe generatie sequence data types verwerken.
• U kunt Bio-Linux te installeren op uw machine, ofwel als het enige besturingssysteem, of als onderdeel van een dual-boot setup waarmee u uw huidige systeem en Bio-Linux te gebruiken op dezelfde hardware.
• Bio-Linux draait ook live vanaf de DVD of een USB-stick. Dit loopt in het geheugen van uw machine en niet gepaard gaat met iets te hoeven installeren. Dit is een grote, probleemloze manier om uit te proberen Bio-Linux, te tonen of te leren met het, of om mee te werken wanneer u onderweg bent.
• Bio-Linux is gebaseerd op open source systemen en software, en is dus vrij om te installeren en te gebruiken.