QMForge project kan worden gebruikt om de resultaten van kwantumchemie (DFT) berekeningen analyseren. Gauss 98/03, ADF, GAMESS (US), GAMESS (UK), PC-GAMESS, Jaguar en ORCA-bestanden worden ondersteund (zie hieronder). De volgende analyses zijn beschikbaar:
· Mulliken Bevolking Analysis (MPA)
· C-kwadraat Bevolking Analyse (SCPA)
· Overlap Bevolking Analyse (OPA)
· Mayer's Bond Bestellingen
· Charge Decompositie Analyse (CDA)
· Fragmentanalyse
MPA, CSPA en OPA vereisen een door de gebruiker gedefinieerde set van fragmenten, en drukt het percentage bijdragen die fragmenten te maken naar elkaar moleculaire orbitaal in het molecuul. Mayer's bond orders berekent obligatieorders tussen elk paar van atomen in het molecuul. CDA en fragmentanalyse mag drie of meer berekeningen (een voor het gehele molecuul en twee fragment berekeningen), en informatie over de binding interacties tussen fragmenten.
QMForge is de directe afstammeling van PyMOlyze, die werd geïnspireerd door de console-gebaseerde, (oorspronkelijk) Windows-only programma AOMix die functies, waaronder (en naast) de hierboven genoemde heeft. Ik aanvankelijk schreef PyMOlyze want ik wilde een (grafische dwz.) Linux programma gebruikersvriendelijk te doen MPA voor elke moleculaire orbitaal van Gauss berekeningen. Ik heb uitgebreid tot bestanden verwerken van geometrie optimalisaties omdat ik vond mezelf willen dat ik kon vertalen en draai de geoptimaliseerde structuur en op te slaan die als een XYZ-bestand. Nu, het is omgedoopt QMForge, en ik gebruik het voor bijna alles, behalve het maken van moleculaire orbitaal foto's en diagrammen.
Er zijn nog een aantal analyses die QMForge niet doen, dus als het niet het adres van uw behoeften, check out AOMix (of schiet me een email en we zullen praten).
QMForge is gemaakt met behulp van de Python scripttaal, de Qt4 toolkit en de python extensies PyQt4, Numeriek, en de cclib compuational pakket parsing bibliotheek. Het is getest op Windows XP, Windows 2000 en Mac OS X; het zou moeten werken net zo goed op een GNU / Linux distributie, hoewel ik het nog niet getest.
Wat is er nieuw in deze release:
· Naamswijziging naar QMForge
· ORCA ondersteuning
· Wijzig naar numpy 1.0.2 en 2.1.1 openbabel
· Gebruikt cclib opgebouwd uit de 0.8 tak + unreleased ORCA parser
Reacties niet gevonden