Swiss-PdbViewer (aka DeepView) is een applicatie die een gebruiksvriendelijke interface mogelijk maakt om verschillende eiwitten te analyseren op hetzelfde moment biedt. De eiwitten kunnen worden gelegd met het oog op structurele afstemmingen afleiden en vergelijken hun actieve sites of enige andere relevante onderdelen. Aminozuur mutaties, H-obligaties, hoeken en afstanden tussen de atomen zijn eenvoudig te bedienen dankzij het verkrijgen van de intuïtieve grafische en menu-interface.
Swiss-PdbViewer (aka DeepView) is ontwikkeld sinds 1994 door Nicolas Guex. Swiss-PdbViewer is nauw verbonden met SWISS-MODEL, een geautomatiseerde homologie modellering server ontwikkeld in het Zwitserse Instituut voor Bio-informatica (SIB) bij de structuurfondsen Bioinformatics Group bij de Biozentrum in Bazel.
werken met deze twee programma vermindert de hoeveelheid werk nodig construeren, omdat het mogelijk is om een eiwit primaire sequentie draad op een 3D template en ontvang onmiddellijke feedback over hoe goed de schroefdraad eiwit zal door de referentie-structuur geaccepteerd voordat het indienen van een verzoek om ontbrekende loops te bouwen en te verfijnen zijketen verpakking.
Swiss-PdbViewer kunt ook lezen elektronendichtheid kaarten, en biedt diverse hulpmiddelen op te bouwen in de dichtheid. Daarnaast zijn er diverse modeling tools zijn geïntegreerd en commando-bestanden voor populaire energieminimalisatie pakketten kunnen worden gegenereerd.
Tot slot, als een speciale bonus, POV-Ray scènes kunnen worden gegenereerd op basis van de huidige weergave om prachtige ray-getraceerd kwaliteit foto's te maken.
Wat is nieuw in deze release:
- De Thymine C6 atoom is nu correct geladen
- Fixed de POV-Ray-uitgang eindeloze lus op de PC-versie
- De occasionele crash tijdens het opslaan van VOB bestanden (zoals 2i37) op de PC is vastgesteld
- Bijgewerkt het adres van de Uppsala elektronendichtheid Map Server
Reacties niet gevonden