MultiGeneBlast is een open source tool gebaseerd op een opnieuw formatteren van de FASTA headers van NCBI GenBank eiwit inzendingen, met behulp waarvan kan sporen hun bron nucleotide en coördinaten. MultiGeneBlast kan helpen bij het opsporen van dergelijke multigenfamilie onderdelen voor synthetische biologieprojecten. Een synthetische bibliotheek van operons kunnen worden gemaakt op basis van zijn uitgang die operons wiens functie dichtst bij de gewenste door de gebruiker te identificeren. Deze tool biedt de mogelijkheden om alle homologe genomische regio's te identificeren door het combineren van de resultaten van enkele BLASTP draait op elk gen, en sorteren van genomische regio's vanaf elke GenBank invoer door het aantal hits, behoud synteny, en cumulatief Blast beetje score. Architectuur zoekopdrachten kunnen worden uitgevoerd om eventuele genomische regio 'met Blast schiet elke gebruiker gespecificeerde combinatie van aminozuursequenties.
Reacties niet gevonden