Ascalaph Designer

Ascalaph Designer is een general-purpose programma voor moleculaire dynamische simulaties. Onder een grafische omgeving worden weergegeven als hun toepassing van moleculaire dynamica en de werkwijzen van klassieke en kwantum mechanica van populaire programma. Kenmerken omvatten moleculaire graphics: meerdere vensters, twee camera per model, CPK, Draad frame, Stick, bal en stok, en CPK Draadmodel stijlen, moleculaire modelbouw: kristal bouwer, ketting bouwer, tekenen met de muis, moleculaire geometrie editing, voorlopige optimalisatie , quantum-optimalisatie, en botsingen verwijderen, moleculaire geometrie optimalisatie met geconjugeerde gradiënt methoden, moleculaire dynamica: multiple tijd stap integratie, vierde orde integratie, supercomputer berekeningen met behulp van MDynaMix, flexibele SPC water model en de impliciete water-model, en quantum chemie met behulp van CP2K en PC GAMESS / Firefly:. energie, moleculaire geometrie optimalisatie en mogelijke afgeleide kosten