GenoSuite is een raamwerk ontwikkeld voor proteogenomic analyse. FDRScore based strategie wordt gebruikt om de resultaten van meerdere zoekalgoritmen integreren. Prokaryote Proteogenomic Tool (PPT) wordt ontwikkeld als onderdeel van GenoSuite kader. PPT is voor het vinden van nieuwe vertalingen in prokaryote genomen en is afhankelijk van massaspectrometrie gebaseerde proteomics data en aanverwante genoomsequentie. Functies zijn geconfigureerd voor 4 open source algoritmes om de database uit te voeren op zoek naar identificatiepeptide en combinatie van de 4-algoritme elke gekozen kan worden, geeft het genoom zoeken specifieke peptiden (Novel peptiden), kunnen spectrale wedstrijden worden gevisualiseerd voor de kwaliteitsbeoordeling, lijsten uit de nieuwe eiwitten en veranderingen in de bestaande eiwit annotaties en een visuele genomische context van de nieuwe peptiden kunnen ook worden gegenereerd.
Reacties niet gevonden