DOLFIN

Dit is een eenvoudige, consistente en intuïtieve object-georiënteerde API in C ++ en Python

Kenmerken .

• Automatische en efficiënte evaluatie van eindige elementen variatieprincipe vormen door FFC of SyFi
• Automatische en efficiënte assemblage van lineaire systemen
• Algemeen families van eindige elementen, waaronder willekeurige volgorde continue en discontinue Lagrange eindige elementen, BDM elementen, RT-elementen, BDFM elementen, Nedelec elementen en Crouzeix-Raviart
• Willekeurige gemengde elementen als combinatie van basiselementen, zoals bijvoorbeeld Taylor-Hood
• Discontinuous Galerkin methoden, met inbegrip sprong termen, gemiddelden, en integralen ruim interieur mesh facetten
• High-performance lineaire algebra door uBLAS, PETSc, Trilinos en MTL4 (experimenteel) met eenvoudige C ++ en Python wrappers
• Parallel montage en lossen
• Simplex mazen in 1D, 2D (driehoeken), en 3D (tetraëders), inclusief adaptieve netverfijning
• Multi-adaptieve MCG (q) / MDG (q) en mono-adaptieve cG (q) / dG (q) ODE solvers
• Ondersteuning voor een reeks van input / output formaten, waaronder DOLFIN XML, VTK, Octave, MATLAB, Diffpack, Exodus II

Wat is nieuw in deze release:

• Deze release brengt een groot aantal saneringen en bug fixes relatieve aan de onlangs vrijgegeven DOLFIN 1.0-beta2.

Wat is nieuw in versie 0.9.11:

• Verander licentie van LGPL v2.1 naar LGPL v3 of later
• Verplaatst meshconverter om dolfin_utils
• Voeg steun voor de omzetting van materiaal markers voor Gmsh mazen
• ondersteuning toevoegen voor puntbronnen (klasse Pointsource)
• Naam logging - & # x3e; set_log_active
• parameter & quot toevoegen; clear_on_write & quot; tot tijdreeks
• ondersteuning toevoegen voor input / output van geneste parametersets
• Controleer afmetingen in lineaire algebra
• Voeg ondersteuning voor automatische foutcorrectie voor variatieprincipe problemen
• ondersteuning voor verfijning van MeshFunctions Voeg na netverfijning
• Wijzig de volgorde van testen en berechting ruimten in Vorm constructeurs

Wat is nieuw in versie 0.9.10:

• ondersteuning voor automatische foutcorrectie voor variatieprincipes problemen toevoegen.
• ondersteuning toevoegen voor verfijning van MeshFunctions na netverfijning.

Wat is nieuw in versie 0.9.9:

• Verander build systeem om CMake
• Voeg vernoemd MeshFunctions: VertexFunction, EdgeFunction, FaceFunction, FacetFunction, CellFunction
• Laat het instellen van een constante randvoorwaarden direct zonder gebruik van Constant
• Laat het instellen van randvoorwaarden op basis van string (& quot; x [0] == 0.0 & quot;)
• Maak ontbrekende directories indien gespecificeerd als onderdeel van bestandsnamen
• Laat hergebruik van preconditioners voor de meeste backends
• Oplossingen voor UMFPACK solver op sommige 32 bit machines
• Zorg voor toegang tot meer Hypre preconditioners via PETSc
• Updates voor SLEPc 3.1
• Verbeteren en hergebruik van LU factorisaties implementeren voor alle backends
• Fix bug in de verfijning van MeshFunctions

Wat is nieuw in versie 0.9.3:

• Voeg globale parameter & quot; ffc_representation & quot; voor vorm vertegenwoordiging in FFC JIT-compiler
• Maak norm () functie hanteren beide vectoren en functies in Python
• Speedup periodieke randvoorwaarden en maak werk voor gemengd (vector-waarde) elementen
• mogelijkheden toevoegen aan een willekeurig aantal numpy array bij het toewijzen van matrices en vectoren
• mogelijkheden toevoegen aan elk geheel getal numpy array voor indices in matrices en vectoren te gebruiken
• Fix voor int typemaps in PyDOLFIN
• Split mult in mult en transpmult
• Filter uit PETSc argument bij het ontleden van commandoregel parameters
• uitbreiden reacties op interface-bestanden slok
• Voeg copyright verklaringen aan SWIG interface-bestanden (nog niet klaar)
• typemaps voor misc std :: vector & # X3c toevoegen; soorten & # x3e; in PyDOLFIN
• Verwijder afhankelijkheden std_vector.i verminderen SWIG wrapper grootte van de code
• Gebruik relatieve% omvat in dolfin.i
• Gewijzigde namen op SWIG interface-bestanden dolfin_foo.i - & # x3e; foo.i
• Voeg functie interpolate () in Python-interface
• Fix typmaps voor uint in python 2.6
• Gebruik TypeError plaats van ValueError in typechecks in typmaps.i
• Voeg in / out shared_ptr & # X3c; Epetra_FEFoo & # x3e; typemaps voor PyDOLFIN
• Fix JIT compilatie parallel
• Voeg een compile_extension_module functie in PyDOLFIN
• Fix bug in Python vector opdracht
• Voeg ondersteuning voor samengeperste base64 gecodeerde VTK-bestanden (met behulp van zlib)
• ondersteuning toevoegen voor base64 gecodeerde VTK-bestanden
• Experimentele ondersteuning voor parallelle montage en lossen
• Bug fix in project () functie, update naar UFL syntax
• Verwijder disp () functies en vervangen door informatie (foo, true)
• Voeg fem unit test (Python)
• Opruimen SystemAssembler
• Inschakelen assemble_system via PyDOLFIN
• Voeg 'norm' te GenericMatrix
• Efficiency verbeteringen in NewtonSolver
• Naam wijzigen NewtonSolver :: get_iteration () om NewtonSolver :: iteratie ()
• Verbeteringen aan EpetraKrylovSolver :: lossen
• Voeg constructor Vector :: Vector (const GenericVector & x)
• Verwijder SCons deprecation waarschuwingen
• Geheugenlek fix in PETScKrylovSolver
• Naam wijzigen dolfin_assert - & # x3e; doen gelden en gebruik C ++ versie
• Fix debug / optimaliseren vlaggen
• Verwijder AvgMeshSize, InvMeshSize, InvFacetArea van SpecialFunctions
• Naam wijzigen MeshSize - & # x3e; CellSize
• Rewrite parameter-systeem met verbeterde ondersteuning voor command-line parsing,
• lokalisatie van parameters (per klas) en de bruikbaarheid van Python
• Verwijder OutflowFacet uit SpecialFunctions
• Naam wijzigen interpolate (dubbel *) - & # x3e; interpolate_vertex_values ​​(dubbel *)
• Voeg Python versie van Cahn-Hilliard demo
• Fix bug in assemble.py
• Permit interpolatie van functies tussen niet-matching mazen
• Verwijder Functie :: Functie (std :: string filename)
• De overgang naar de nieuwe XML-io
• Verwijder GenericSparsityPattern :: soort
• Vereisen naargelang / ongesorteerd parameter in SparsityPattern constructeur
• de prestaties van SparsityPattern :: insert
Verbeteren
• Vervang opsommingen met strijkers voor lineaire algebra en ingebouwde mazen
• Sta directe toegang tot Constant waarde
• entiteiten in MeshEntity constructor initialiseren automatisch en laat scala
• Voeg unit tests om de memorycheck
• Gesprek toevoegen om op te ruimen libxml2 parser bij afslag
• Verwijder overbodige nieuwe argumenten in DofMap lid functies
• Verwijder verwijzing constructeurs uit DofMap, FiniteElement en FunctionSpace
• Gebruik een shared_ptr om het gaas te slaan in DofMap objecten
• Interface verandering voor wrapper code: PoissonBilinearForm - & # x3e; Poisson :: BilinearForm
• Voeg functie info_underline () voor het schrijven onderstreepte berichten
• Naam wijzigen bericht () - & # x3e; info () voor & quot; compatibiliteit & quot; met Python logging module
• Voeg elementwise vermenigvuldiging in GeneriVector-interface
• GenericVector-interface in PyDOLFIN ondersteunen nu de volgorde protocol
• Naam wijzigen van camelCaps functies namen: Foobar - & # x3e; foo_bar
• Voeg snijden mogelijkheden voor GenericMatrix-interface in PyDOLFIN (alleen getItem)
• Voeg snijden mogelijkheden voor GenericVector-interface in PyDOLFIN
• som Toevoegen aan GenericVector-interface