bint

bint is een software is voor het verkrijgen subsets intensiteit gegevens van genotypering assays geschreven. & Nbsp; ofwel de X & Y intensiteiten maken cluster plots meld verhouding R en B allelfrequenties voor CNV detectie.
Extraheren van de gegevens voor de individuele SNP / CNV markers en individuele monsters was traag grep / awk'ing de tekstbestanden die uit de genotypering run (bijvoorbeeld Illumina eindrapport bestanden).
bint converteert de tekst representatie van de intensiteit float gegevens in een IEEE754 geïndexeerde binair bestand voor snelle extractie van subsets van de gegevens. In theorie zou bint worden gebruikt voor grote tabellen van de vlotter data.