Actueel neuroimaging software bieden gebruikers een ongelooflijke kans om gegevens te analyseren met behulp van een verscheidenheid van verschillende algoritmes. Dit heeft echter geleid tot een heterogene verzameling van gespecialiseerde toepassingen zonder transparante interoperabiliteit of uniforme bedieningsinterface.
Nipype is een open-source, community ontwikkelde initiatief onder de paraplu van nipy, is een Python-project, dat een uniforme interface naar bestaande neuroimaging software biedt en vergemakkelijkt de interactie tussen deze pakketten binnen één workflow. Nipype biedt een omgeving die interactieve verkenning van algoritmen uit verschillende pakketten (bijv, SPM, FSL, FreeSurfer, Afni, Slicer), vereenvoudigt het ontwerp van workflows binnen en tussen de pakketten, en vermindert de leercurve die nodig zijn om verschillende pakketten te gebruiken stimuleert. Nipype is het creëren van een gezamenlijke platform voor neuro-imaging software ontwikkeling in een high-level taal en het aanpakken van de beperkingen van de bestaande pijpleiding systemen.
Nipype kunt u:
& Nbsp; gemakkelijk communiceren met gereedschappen uit verschillende softwarepakketten
& Nbsp; combineren processtappen uit verschillende softwarepakketten
& Nbsp; het ontwikkelen van nieuwe workflows sneller door hergebruik van gemeenschappelijke stappen van oude
& Nbsp; procesgegevens sneller draaien door hem parallel op vele kernen / machines
& Nbsp; gemakkelijk reproduceerbaar maken van uw onderzoek
& Nbsp; deel uw verwerking workflows met de gemeenschap
Documentatie: http://nipy.sourceforge.net/nipype/documentation.html#documentation
Requirements:
- Python
Reacties niet gevonden