GENESIS (kort voor algemene neurale simulatie System) is een algemeen doel simulatie platform, dat werd ontwikkeld om de simulatie van neurale systemen, variërend van subcellulaire componenten en biochemische reacties op complexe modellen van enkele neuronen, simulaties van grote netwerken en systemen-ondersteuning level modellen.
Genesis is de basis voor practica in neurale simulatie bij Caltech, het Marine Biological Laboratory, de Crete, Trieste, Bangalore en Obidos korte cursussen in Computational Neuroscience, en ten minste 49 universiteiten waarvan we ons bewust zijn.
De meeste huidige GENESIS toepassingen betrekken realistische simulaties van biologische neurale systemen. Hoewel de software kan ook modelleren meer abstracte netwerken, andere simulatoren zijn meer geschikt voor backpropagation en soortgelijke connectionistische modellen.
Installatie
1. Kies de plaats waar u wilt de "genesis" directory tree te installeren. Als u het maken van een systeem-brede installatie als "root" gebruiker / usr / local is een goede keuze. Voor een persoonlijke installatie, zonder root privileges, kunt u uw home-directory ("~") te gebruiken. Wissel naar deze directory en pak de ontstaansgeschiedenis directory van het archiefbestand genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Bijvoorbeeld,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
of waar u het (bijvoorbeeld ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz) hebben.
2. Ga naar de map "genesis" en voer het setup-script dat de ".simrc" Genesis initialisatie file "creëert. Kopieer vervolgens .simrc naar je home directory.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. finallly, voeg de genesis map om uw zoekopdracht pad, zodat "genesis" kan worden gevonden uit elke map die je bent. Als je login-shell is bash, kunt u dit doen door in je home directory bewerken van het .bashrc bestand aan de lijn toe te voegen
PATH = $ PATH: / usr / local / Ontstaan
aan het einde van het bestand. Als u gebruik maakt van tcsh of csh als uw command shell, voeg
set path = ($ pad / usr / local / Ontstaan)
uw .tcsh of .csh bestand.
Op dit punt, bent u klaar om te proberen lopen GENESIS. Verander in de directory genesis / Scripts en probeer een aantal van de tutorials voorgesteld in het README bestand
Wat is nieuw in deze release:.
- Talloze bugfixes en verbeteringen.
Reacties niet gevonden