Serial Cloner

Serial Cloner is een moleculaire biologie software. Het biedt hulpmiddelen met een intuïtieve interface die u helpt bij het DNA-klonen, sequentie-analyse en visualisatie. Serial Cloner is ontwikkeld om een ​​licht moleculaire biologie software zowel Macintosh als Windows gebruikers. Serial Cloner leest en schrijft DNA Strider (tm) compatibele bestanden en import en export bestanden in de universele FASTA formaat (evenals in pDRAW32 formaat). Krachtige grafische weergave gereedschappen en eenvoudige interfaces helpen de analyse en de bouw stappen (adapter, PCR, Gateway [tm] klonen) in een zeer intuïtieve manier. Versie 1.3 voegt nu een virtuele snijmachine, een web browser met instant import van NCBI / EMBL inzendingen en een stille restrictie kaart samen met andere verbeteringen.

Wat is nieuw in deze release:

• [NEW] Schattingen Isoëlektrisch punt van eiwit sequenties (DNA en eiwit Sequence venster)
• [NEW] MacOSX versie nu verspreid als een ondertekende aanvraag (Mountain Lion Gatekeeper compatibiliteit)
• [TOEGEVOEGD] Een optie in de Voorkeuren om pK waarde tabellen selecteren om te gebruiken voor pi schatting
• [TOEGEVOEGD] Een optie in de voorkeuren van de Codon code uit codongebruik tabellen gebruiken als een genetische code die wordt gebruikt voor de vertaling
• [TOEGEVOEGD] Een optie in het Beperking kaartvenster om alleen nucleotiden die in hoofdletters
vertalen
• [TOEGEVOEGD] Een knop / menu om bepaalde sites te kiezen die moet worden weergegeven in Restrictiekaarten.
• [TOEGEVOEGD] Scan voor peptide Functies in proteïnesequenties
• [TOEGEVOEGD] Overnemen features bij het reverse-vertalen van een DNA-sequentie
• [TOEGEVOEGD] Een snelle overschakeling tussen een DNA en eiwit raam uitlijnen
• [TOEGEVOEGD] Niet geformatteerd kopie van Eiwitsequentie (Copy Meer ... Menu)
• [TOEGEVOEGD] Overnemen features bij het kopiëren / plakken proteïnesequenties
• [TOEGEVOEGD] Beeldschermfuncties in Protein uitlijnen (Local Align)
• [TOEGEVOEGD] Een schakelknop aan verschillen in lijn eiwitten markeren
• [TOEGEVOEGD] Een snelkoppeling (S) om snel te zien of het masker functies (in de tab Functies van Sequence Windows)
• [TOEGEVOEGD] 'Anker' en 'Core' domeinen van primers worden nu erkend als functies in Sequence Windows
• [TOEGEVOEGD] Een knop om snel een volledige lineaire insert in het venster 'Bouw een Construct'
• [TOEGEVOEGD] Toegevoegd een snelkoppeling naar 'Copy niet geformatteerde' [Command-Shift-K]
• [TOEGEVOEGD] Een menu-optie om naar Serial Cloner Forum
• [TOEGEVOEGD] Een menu-optie om naar Serial Cloner Youtube Channel (handleiding)
• [UPDATE] Het is nu mogelijk om volledig formaat Sequence ramen
• [UPDATE] Afwezig gebieden worden aangegeven in cursief in enzym chooser ramen (Kaarten Grafische en Restriction)
• [UPDATE] Unieke locaties zijn vetgedrukt in enzym chooser ramen (Kaarten Grafische en Restriction)
• [UPDATE] parseren van NCBI sequenties (Web Access) om rekening te houden veranderingen in NCBI pagina's.
• [UPDATE] Verbeterde parsing van sequenties die 'X' in de nucleotidesequentie
• [UPDATE] Gewijzigde snelkoppeling van 'Copy All Sequences Om MultiFASTA' aan [Command-Shift-J] in plaats van [Command-Shift-K]
• [GECORRIGEERD] Een Windows-specifieke interface bug het raam van de 'Import codonbias'
• [GECORRIGEERD] Een bug soms voorkomen dat een goede kopie van afbeeldingen (Grafische kaart, Virtual Cut, shRNA) op het klembord (Windows-specifieke)
• [GECORRIGEERD] Een probleem dat rijst met ongewoon RE namen als R1.BceSIV in het bijzonder enzym "chooser van de grafische kaart.
• [GECORRIGEERD] Een probleem [Gateway Klonen] met Features indicatie wanneer de bestemming vector was antisense (ATT2-ATT1 richting)
• [GECORRIGEERD] Een bug in de selectie van de meest gebruikte AA wanneer de achteruitversnelling vertalen
• [GECORRIGEERD] Een probleem met "Alles selecteren" in Sequence en Protein ramen
• [GECORRIGEERD] A Bestand type probleem in verband met Serial Cloner-bestanden (het breken van compatibiliteit met Sequencher import in het bijzonder)
• [GECORRIGEERD] Ligatie: soms onnodig geproduceerd ontaarde DNA
• [GECORRIGEERD] Gateway: gegenereerde DNA maar dan als dan bewaard als onbekende soort
• [GECORRIGEERD] PCR:. Indien het wordt gedaan op "onbekend formaat" sequence, onjuist gegenereerd "Eiwit" type
• [GECORRIGEERD] Een probleem updaten Feature bij het ongedaan maken van een wijziging
• [GECORRIGEERD] Bij het plakken van een eiwit sequentie in GenBank formaat (NCBI) een proteïnesequentie venster is nu correct aangemaakt.
• [GECORRIGEERD] Een probleem met de NCBI BLAST-server bij gebruik van niet-ASCII-tekens in Sequence namen
• [GECORRIGEERD] Een probleem met Feature scherm na een scan wanneer slechts één Feature werd gevonden
• [GECORRIGEERD] Een zeldzaam probleem van Feature-display in de Construct Window
• [GECORRIGEERD] Een refresh probleem bij het gebruik lettergrootte verschillend van 12 pt in grafische kaarten.
• [GECORRIGEERD] Een bug in de Restrictiekaart ramen waar de eerste lijn van het aminozuur vertaling werd verschoven in codon modus
• [GECORRIGEERD] Een bug gerelateerd voorkomen van het gebruik van de eerder geselecteerde enzymen in de Virtuele Snijmachine Window