MacVector

        MacVector is een uitgebreide Macintosh-applicatie die sequentiebewerking, primerontwerp, internetdatabase zoeken, eiwitanalyse, sequentiebevestiging, meerdere sequentie-uitlijning, fylogenetische reconstructie, codeerregioanalyse en een groot aantal andere functies biedt. MacVector wordt algemeen beschouwd als het meest intuïtieve, gemakkelijk te gebruiken programma dat beschikbaar is voor sequentie-analyse.
    

Wat is nieuw in deze release:

Enkele kleine problemen met Align To Reference bij het lezen van uitlijningen die beginnen bij het laatste residu van cirkelreeksen, zijn gerepareerd.

Wat is nieuw in versie 16.0.6:

Enkele kleine problemen met Align To Reference bij het lezen van uitlijningen die beginnen bij het laatste residu van cirkelreeksen, zijn opgelost.

Wat is nieuw in versie 16.0.2:

Een crash bij het oproepen van de Align to Reference Add Seqs-functie op OS X 10.7 en OS X 10.8 is opgelost .

Wanneer u een reeks in GenBank-indeling exporteert, schrijft MacVector nu alle GenBank-functies, zelfs als deze op dit moment verouderd zijn.

Wat is nieuw in versie 15.5.4:

De Double-digest-uitvoer van het restrictie-enzym werkt nu zoals verwacht wanneer slechts twee of drie enzymen zijn geselecteerd.

Wat is nieuw in versie 15.1.4:

De 3/6 framevertaling in de enkele-reekseditor houdt het frame nu correct
na een regelafwikkeling.

Een crash bij het inschakelen van 3/6 frames vertalen in de Align To Reference Editor met a
reeks groter dan 65.000 residuen is gerepareerd.

Wat is nieuw in versie 15.1.3:

Een fout in de Multiple Sequence Alignment Editor is opgelost . Het effect van deze bug was dat er aan het begin van sequenties soms extra residuen verschenen toen ze werden opgeslagen. Dit betrof alleen MSA-documenten die werden bewerkt. Als u net uitgelijnd bent met ClustalW / Muscle / T-Coffee en hebt opgeslagen zonder te bewerken, zouden de uitlijningen correct zijn.

Wat is nieuw in versie 15.1.1:

loopt vast bij het opslaan van bepaalde bewerkte Multiple Sequence Alignment
(.msan, .msap) documenten zijn opgelost.

Een bug waarbij sommige fastq-reads meerdere keren zouden worden uitgeschreven uit de resultaten van een zoekopdracht naar Align To Folder is opgelost.

Wat is nieuw in versie 14.5.3:

Een incidentele crash in de functie Uitlijnen op map is opgelost.

Een zeldzame crash bij het testen van primersparen is opgelost

Wat is nieuw in versie 14.5.2:

Uitlijnen op map verwerkt nu correct zoekopdrachten met een segment van een reeks die de cirkelvormige oorsprong kruist.

Als u 'Automatisch RE zoeken' in de Kaartvoorkeuren in- of uitschakelt, worden alle geopende vensters correct bijgewerkt.

Wat is nieuw in versie 14.0:

Afgezien van de prestatieverbetering bij het werken met grote reeksen en uitlijningen, zijn er significante verbeteringen in de verwerking van primers (inclusief ondersteuning voor primer-databases) en NGS-gegevens.

Wat is nieuw in versie 13.5.5:

Een probleem met kenmerken van het type "????" wordt gemaakt wanneer het openen van een opgeslagen Align To Reference-bestand (.axml) is voltooid.

Wat is nieuw in versie 13.5.3:

• Het Contig Editor-scherm wordt nu correct vernieuwd op OS X 10.6 bij het laden van een opgeslagen uitlijning.
• Er is een crash opgelost in de Protein Analysis Toolbox.
• Een crash in de Quicktest Primer-interface bij het werken met grote aantallen restrictie-enzymen is opgelost.

Wat is nieuw in versie 13.5.2:

Een schuifprobleem in de Contig Editor / Align To Reference Editor is verholpen. Een zeldzame crash bij het wakker worden op een ander netwerk is verholpen.

Wat is nieuw in versie 13.5.1:

• Op OS X 10.6 behouden geïmporteerde reeksen nu hun oorspronkelijke bestandsnaam.
• Een occasionele crash-sluiting van gewijzigde sequenties die niet zijn opgeslagen, is opgelost.
• Vertalingen in de geannoteerde tekstuitvoer voldoen nu correct aan de voorkeurenvlaggen.
• Sommige inconsistenties in de nummering van "naamloze" reeksen zijn opgelost.
• Een probleem waarbij sequentievensters zouden verdwijnen onder OS X 10.6 is opgelost,
• Een aantal foutmeldingen in het scherm Align To Reference is opgelost.
• Een probleem waarbij vertalingen soms ontbreken op het tabblad Map wanneer is ingezoomd op het residuniveau is opgelost.
• De mogelijkheid om BAM-bestanden te importeren in een Assembler-project is hersteld.
• Nucleïnezuur meerdere uitlijningsdocumenten hebben nu hun eigen kleurgroep en blokkerende standaardwaarden.
• Primers in de "Test PCR Primer Pair" -modus van Primer Design kunnen nu langer zijn dan 35 nt.
• Tekstweergaven worden nu automatisch in breedte aangepast om op één pagina af te drukken.

Wat is nieuw in versie 13.5:

De grafische symbolen-editor en het zwevende grafische palet zijn herschreven als voorbereiding op de MacVector die naar een 64-bits architectuur verhuist (te wijten aan MacVector 14.0). De andere belangrijkste verbeteringen waren gericht op een betere afhandeling van Next Generation Sequencing (NGS) -bestanden, met name met de Align To Folder en Assembler Velvet de novo assembly-functionaliteit. Er is ook enige code-optimalisatie geweest om beter om te gaan met de analyse van grote genoomsequenties, vooral merkbaar met de Pustell Matrix "dot-plot" -functionaliteit.