MISO (mengsel van isovormen) is een probabilistisch raamwerk geschreven in Python dat het expressieniveau & nbsp kwantificeert; van alternatief gesplitste genen van RNA-Seq data, en identificeert differentieel gereguleerde isovormen of exons tegenover monsters.
Door het modelleren van de generatieve proces waardoor leest worden uit isovormen RNA-Seq de MISO model Bayesiaanse gevolgtrekking de kans dat een lees afkomstig van een bepaalde isovorm te berekenen.
MISO maakt gebruik van de afgeleide toewijzing van leest isovormen aan de abundanties van de onderliggende set van alternatieve mRNA isovormen kwantificeren. Betrouwbaarheidsintervallen overschattingen kan worden verkregen, die de betrouwbaarheid van de ramingen te kwantificeren.
Zie http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ voor MISO handleiding en documentatie
Eisen .
- Python
Reacties niet gevonden